課程資訊
課程名稱
生態資料探勘與分析
Ecological Data Mining and Analysis 
開課學期
104-2 
授課對象
生物資源暨農學院  森林環境暨資源學研究所  
授課教師
關秉宗 
課號
Forest7050 
課程識別碼
625 M2510 
班次
 
學分
全/半年
半年 
必/選修
選修 
上課時間
星期三6,7,8,9,10(13:20~18:20) 
上課地點
木性 
備註
限碩士班以上
總人數上限:15人 
Ceiba 課程網頁
http://ceiba.ntu.edu.tw/1042Forest7050_EDMA 
課程簡介影片
 
核心能力關聯
核心能力與課程規劃關聯圖
課程大綱
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
課程概述

生態資料常具複雜之特性,如具時間與空間之相關性,非線性結構等。是以分析此類資料常非僅修習過基礎統計之研究生所能勝任。本課程之目標乃在經由一系列分析方法之介紹與案例分析,使生態領域之研究生瞭解與分析其所蒐集之資料,並協助其以最精簡有效之方式呈現其資料特性 

課程目標
修習本課程之學生將會使用R統計軟體分析,管理與繪製其資料;並將瞭解與正確地運用廣義線型模式(Generalized Linear Model),廣義加成模式(General Additive Model),非參數分析方法(Nonparametric methods),半參數分析方法(Semi-parametric methods),混合效應模式(Mixed-effects model)等方法於資料分析上 
課程要求
欲修習本課程之學生必須修習過統計學,瞭解線型模式(迴歸與變方分析)之基礎觀念,並需自備筆記型電腦與欲分析之資料

修課人數上限10人  
預期每週課後學習時數
 
Office Hours
每週四 13:30~15:30 
指定閱讀
James, G., Witten, D., Hastie, T., and Tibshirani, R. 2013. An Introduction to Statistical Learning with Applications in R. Springer, New York. [electronic resource]

Torgo, L. 2011. Data Mining with R: Learning with Case Studies. CRC Press, Boca Raton. [electronic resource]

Williams, G. 2011. Data Mining with Rattle and R: The Art of Excavating Data for Knowledge Discovery. Springer, New York. [electronic resource]  
參考書目
Ekstrøm, C.T., 2011. The R Primer. CRC Press [electronic resource]

Horton, N., Kleinman, K., 2011. Using R for Data Management, Statistical Analysis, and Graphics. CRC Press [electronic resource]

Hastie, T., Tibshirani, R., Friedman, J., 2009. The Elements of Statistical Learning. Data Mining, Inference, and Prediction. 2nd ed. Springer [electronic resource]

Sarkar, D., 2008. Lattice: Multivariate Data Visualization with R. Springer [electronic resource]

Murrell, P., 2006. R Graphics. CRC Press [electronic resource]  
評量方式
(僅供參考)
 
No.
項目
百分比
說明
1. 
報告(含書面及口頭報告)  
100% 
 
 
課程進度
週次
日期
單元主題
第1週
2/24  Introduction to Data Mining and R 
第2週
3/02  Simple R Programming and Data Analysis  
第3週
3/09  Introduction to Rattle 
第4週
3/16  Statistical Methods in Data Mining: Supervised Learning
Project Idea Discussion 
第5週
3/23  Statistical Linear Models (I) 
第6週
3/30  Statistical Linear Models (II)  
第7週
4/06  Generalized Linear Model (I) 
第8週
4/13  Generalized Linear Model (II) 
第9週
4/20  Classification: Discriminant Analysis
Project Progress Resport 
第10週
4/27  Advance R Graphics Using Lattice and Grid 
第11週
5/04  Nonparametric Analysis (I) 
第12週
5/11  Nonparametric Analysis (I): Smoothing Splines 
第13週
5/18  General Additive Model (I) 
第14週
5/25  General Additive Model (II) 
第15週
6/01  Statistical Methods in Data Mining: Unsupervised Learning 
第16週
6/08  Clustering 
第17週
6/15  Project Final Report